Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmp1Q99KU0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmp1Q99KU0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms