Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed9Q99KF1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms