Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TrabdQ99JY4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrabdQ99JY4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms