Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lims1Q99JW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms