Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddb2Q99J79 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddb2Q99J79 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms