Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apobec3Q99J72 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms