Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfxn4Q925N1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms