Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Letmd1Q924L1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Letmd1Q924L1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms