Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrif1Q923B3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrif1Q923B3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms