Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim59Q922Y2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim59Q922Y2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms