Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf3Q920N1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms