Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Pde6cQ91ZQ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Pde6cQ91ZQ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6cQ91ZQ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pde6cQ91ZQ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Pde6cQ91ZQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Pde6cQ91ZQ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6cQ91ZQ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Pde6cQ91ZQ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6cQ91ZQ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6cQ91ZQ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Pde6cQ91ZQ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde6cQ91ZQ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde6cQ91ZQ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde6cQ91ZQ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pde6cQ91ZQ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Pde6cQ91ZQ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Pde6cQ91ZQ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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