Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z40

Gbp7, Gbp6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp7Q91Z40 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp7Q91Z40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp7Q91Z40 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp7Q91Z40 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms