Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Synpo2Q91YE8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms