Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Setd3Q91WC0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd3Q91WC0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms