Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN0

Lrp5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp5Q91VN0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrp5Q91VN0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrp5Q91VN0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrp5Q91VN0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms