Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col26a1Q91VF6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col26a1Q91VF6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms