Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RestQ8VIG1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RestQ8VIG1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms