Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf4Q8VE97 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf4Q8VE97 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms