Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d2Q8VD57 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms