Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc18Q8VD24 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zcchc18Q8VD24 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc18Q8VD24 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms