Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn4Q8VCH8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms