Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BbxQ8VBW5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BbxQ8VBW5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BbxQ8VBW5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BbxQ8VBW5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BbxQ8VBW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BbxQ8VBW5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BbxQ8VBW5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms