Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpm8Q8R4D5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpm8Q8R4D5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 441.4 ms