Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxn4Q8K3Q3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxn4Q8K3Q3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxn4Q8K3Q3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxn4Q8K3Q3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxn4Q8K3Q3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxn4Q8K3Q3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxn4Q8K3Q3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxn4Q8K3Q3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxn4Q8K3Q3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms