Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk5rap2Q8K389 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk5rap2Q8K389 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms