Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms