Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd3Q8K2F0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 935.3 ms