Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fcho1Q8K285 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms