Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc43a2Q8CGA3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms