Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ercc8Q8CFD5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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