Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef8Q8CE24 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Pramef8Q8CE24 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Pramef8Q8CE24 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Pramef8Q8CE24 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef8Q8CE24 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms