Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc17Q8CE13 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc17Q8CE13 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms