Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc63Q8CDV6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms