Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc38Q8CDN8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms