Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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