Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A430089I19RikQ8C9W1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms