Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol9bQ8C7I4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol9bQ8C7I4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9bQ8C7I4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9bQ8C7I4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms