Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf428Q8C1M2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms