Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrd1Q8C0R9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrd1Q8C0R9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrd1Q8C0R9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms