Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l1Q8C0J2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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