Protein–RNA interactions for Protein: Q8C033

Arhgef10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef10Q8C033 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Arhgef10Q8C033 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Arhgef10Q8C033 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Arhgef10Q8C033 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Arhgef10Q8C033 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Arhgef10Q8C033 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Arhgef10Q8C033 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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Arhgef10Q8C033 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgef10Q8C033 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Arhgef10Q8C033 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Arhgef10Q8C033 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Arhgef10Q8C033 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Arhgef10Q8C033 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Arhgef10Q8C033 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Arhgef10Q8C033 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Arhgef10Q8C033 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgef10Q8C033 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Arhgef10Q8C033 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms