Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
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Usp47Q8BY87 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
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Usp47Q8BY87 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
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Usp47Q8BY87 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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Usp47Q8BY87 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
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Usp47Q8BY87 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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Usp47Q8BY87 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
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Usp47Q8BY87 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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Usp47Q8BY87 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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Usp47Q8BY87 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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Usp47Q8BY87 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp47Q8BY87 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms