Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Iffo1Q8BXL9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Iffo1Q8BXL9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Iffo1Q8BXL9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Iffo1Q8BXL9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Iffo1Q8BXL9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Iffo1Q8BXL9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Iffo1Q8BXL9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Iffo1Q8BXL9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Iffo1Q8BXL9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms