Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sall4Q8BX22 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms