Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pggt1bQ8BUY9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms