Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUP8

Fam43a, Protein FAM43A, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43aQ8BUP8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam43aQ8BUP8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam43aQ8BUP8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam43aQ8BUP8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms