Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup54Q8BTS4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup54Q8BTS4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup54Q8BTS4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms