Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip4Q8BQP8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms