Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E130116L18RikQ8BMV6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms